Alergické reakce jsou důsledkem chybné imunitní reakce. Vitamín C stabilizuje a reguluje imunitní reakce našeho těla a má důležitý vliv na aktivitu bílých krvinek při rozlišování antigenů na přítel a nepřítel a při tvorbě protilátek. Jeho nedostatek někdy vede k chybné reakci organizmu a přispívá ke vzniku alergie a autoimunity.